Hent poster hjem i MEDLINE-format
MEDLINE-formatet kan konverteres til TAB-format vha. Bibliometry Toolbox > MEDLINE to TAB med følgende datafelter:
PMID (PubMed ID-nummer) | DP (Udgivelsesår/dato) | AU (Alle forfattere, navne adskilt af semikolon) | TI (Artiklens titel) | DE (Emneindeskering: MeSH m.fl.) | DT (Dokumentype) | Source (Tidsskrift, bin, hæfte, sidetal) | ISSN (både p- og e-) | AID (artiklens DOI) | AD (Forfatter - fra AU + adresse) | AB (Abstract) - alle datafelter kompakte, foranstillede blanktegn i MEDLINE-formatet er fjernet.
I AD-feltet er alle enkelte Navn (fra AU) + tilhørende adressestreng markeret med ¤¤¤ foran navn, adresseelementer adskilt af semikolon; "Løse" forfatternavne er adskilt af semikolon. Man kan isolere de "løse" forfatternavne ved at indlæde hele filen i en database, søg enkeltvis ordene: univ, hosp, dept, department, inst og marker de fundne poster. De ikke markerede poster rummer nu de "rene" navne-strenge.
Find PMID-numre for mange poster
NCBI Batch Citation matcher accepterer input med følgende format:
journal_title|year|volume|first_page|author_name|your_key|
- eller:
ISSN|year|volume|first_page|author_name|your_key|
- eller:
PubMed Journal ID|year|volume|first_page|author_name|your_key|
Husk den afsluttende | i hver linie.
Tidsskriftforkortelser og fulde navne er ikke altid lige til at forudse, f.eks. Osteoporosis International
TA - Osteoporos Int
JT - Osteoporosis international : a journal established as result of cooperation
between the European Foundation for Osteoporosis and the National Osteoporosis
Foundation of the USA
- her er det bedre at søge på ISSN alene (uden forklarende tekst i parentes):
IS - 1433-2965 (Electronic)
IS - 0937-941X (Linking)
Oprensning af MeSH
Hvis man ønsker kun at præsentere Major_MeSH, kan man fjerne alle Minor MeSH (uden stjerne) på følgende måde:
Find-erstat: /([a-z&\ ]*?)/ og /([a-z&\ ]*?)$ med ingenting.
Datafelter i PubMed
http://www.nlm.nih.gov/bsd/mms/medlineelements.html
| PubMed Unique Identifier | PMID | Kan gensøges med nummer alene i PubMed, med PMID(xx) i SCOPUS og PMID=xx i Web of Science - brug programmet http://bibliometri.wikidot.com/bibliometry-toolbox#toc3 |
| NLM Unique ID | JID | |
| PubMed Central Identifier | PMC | Link til fuldtekstartikel i PubMed Central |
| PubMed Central Release | PMCR |
Forfatter(e):
| Author | AU | |
| Author Identifier | AUID | http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Astrup%20A%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=24695891 |
| Full Author | FAU | |
| Corporate Author | CN | |
| Investigator Name and Full Investigator Name | IR (FIR) | |
| Affiliation | AD | Fra og med 16. december 2013 medtager PubMed alle forfatteradresser - i det omfang dataleverandørerne leverer dem. Før denne dato er kun førsteforfatters adressse med, denne er til gengæld redigeret. |
| Investigator Affiliation | IRAD | |
| Secondary Source ID | SI |
Tidsskriftet:
| Source | SO | ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pubmed/J_Medline.txt - alle PubMed indekserede tidsskrifter |
| Journal Title Abbreviation | TA | |
| Journal Title | JT | |
| Volume | VI | |
| Issue | IP | |
| Pagination | PG | |
| ISSN | IS | |
| Publication Type | PT |
Hvornår er posten oprettet og ændret:
| Create Date | CRDT | |
| Date Completed | DCOM | |
| Date Created | DA | |
| Date Last Revised | LR | |
| Date of Electronic Publication | DEP | |
| Date of Publication | DP |
Emneklassifikation (MeSH)
| MeSH Terms | MH | |
| Registry Number/EC Number | RN | |
| Substance Name | NM | |
| Personal Name as Subject | PS | |
| Full Personal Name as Subject | FPS |
Andre datafelter:
| Number of References | RF | |
| Abstract | AB | |
| Copyright Information | CI | |
| Article Identifier | AID | Kan indeholde DOI afsluttet med [doi] eller andre koder fra udgiver afsluttet med [pii] |
| Book Title | BTI | |
| Collection Title | CTI | |
| Comments/Corrections | Se alle feltkoder her: http://www.nlm.nih.gov/bsd/mms/medlineelements.html#cc | |
| Edition | EN | |
| Editor and Full Editor Name | ED (FED | |
| Entrez Date | EDAT | |
| Gene Symbol | GS | |
| General Note | GN | |
| Grant Number | GR | http://www.nlm.nih.gov/bsd/grant_acronym.html ; http://www.nlm.nih.gov/bsd/funding_support.html |
| ISBN | ISBN | |
| Language | LA | |
| Location Identifier | LID | Svarer til - og indeholder normalt det samme som AID |
| Manuscript Identifier | MID | |
| MeSH Date | MHDA | |
| Other Abstract | OAB | |
| Other Copyright Information | OCI | |
| Other ID | OID | |
| Other Term | OT | |
| Other Term Owner | OTO | |
| Owner | OWN | |
| Place of Publication | PL | |
| Publication History Status | PHST | |
| Publication Status | PST | |
| Publishing Model | PUBM | |
| Space Flight Mission | SFM | |
| Status | STAT | |
| Subset | SB | |
| Title | TI | |
| Transliterated Title | TT | |
| Volume Title | VTI |
http://expertscape.com/ - meget kreativ brug af pubmed-data
